维生素、氨基酸及衍生品的合成生物学青年研究组

 刘树文博士、项目研究员

 研究方向
   

 1、重大产业需求的维生素、氨基酸及衍生化合物的代谢工程

2、合成生物学元件、器件、底盘等底层技术创新

 

 研究内容

 

研究组主要研究内容为合成生物学底层技术创新驱动的工业微生物代谢工程育种。菌种创制是生物制造的关键核心技术。通过研发新型基因调控元件、传感器、遗传线路和底盘细胞,精细和动态调控代谢流,重构和强化代谢模块、解耦途径串扰和生长偶联,提升维生素、氨基酸及其衍生的材料单体等化学品的生物合成效率,创制达到工业应用水平的工程菌。解析极端发酵环境下的工程菌的生命活动变化规律和适应机制。通过生物制造促进化学品生产方式的绿色升级,对于合成生物学驱动碳中和经济发展具有重大意义。

 

 

  导师简介

 

导师姓名:刘树文

电话:010-64807242

电子邮件:liusw#im.ac.cn(请将#替换为@

通讯地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号,中国科学院微生物研究所,H323室

邮政编码:100101

 

 

 主要学习及工作经历 

 

     - 学习经历 

2003.92007.6 南阳理工学院,生物能源专业,本科 

2007.9-2010.6  南京工业大学生物化工专业,硕士 

2010.92013.6 中国科学院微生物研究所遗传学专业,博士学位

 - 工作经历 

2013.72019.9  中国科学院微生物研究所,助理研究员   

2019.10- 2022.10  中国科学院微生物研究所,副研究员 

2022.11- 至今 中国科学院微生物研究所,项目研究员

 

 

  获奖情况

     

1、中科院青年创新促进会优秀会员,2022 

2、首届全国颠覆性技术创新大赛领域赛优胜奖,2021

3、第二届率先杯未来技术创新大赛决赛优胜奖,2022

4科创中国先导技术榜,2023

5、中关村论坛百项新技术新产品榜单,2022

6、中科院建院70周年创新成果展,2019

7、中国-阿拉伯国家技术转移与创新大会十项主推重要成果2019

8、“智飞杯”年度科研成就奖-产业化奖,2019年和2022

9、中科院青年创新促进会会员,2018

10、银川市产学研奖(3/9),2015

11、首届中科院科技促进发展奖,科技贡献奖二等奖(3/7),2014

12、研究生国家奖学金,2012

13、中国科学院大学保罗生物科技优秀学生特别奖,2012

 

 

  在读研究生 

 

李明洁 硕士生(2021- 

 

 

 代表性论文 

 

1、Liu, Shuwen#; Xiao, Haihan#; Zhang, Fangfang; Lu, Zheng; Zhang, Yun; Deng, Aihua; Li, Zhongcai; Yang, Cui; Wen, Tingyi*; A seamless and iterative DNA assembly method named PS-Brick and its assisted metabolic engineering for threonine and 1-propanol production, Biotechnology for Biofuels, 2019, 12: 0-180  

2、Liu, Shuwen; Liang, Yong; Liu, Qian; Tao, Tongtong; Lai, Shujuan; Chen, Ning; Wen, Tingyi*; Development of a two-stage feeding strategy based on the kind and level of feeding nutrients for improving fed-batch production of L-threonine byEscherichia coliApplied Microbiology and Biotechnology, 2013, 97(2): 573-583 

3、Jiang, Min*;Liu, Shu-Wen; Ma, Jiang-Feng; Chen, Ke-Quan; Yu, Li; Yue, Fang-Fang; Xu, Bing; Wei, Ping; Effect of growth phase feeding strategies on succinate production by metabolically engineeredEscherichia coliApplied and Environmental Microbiology, 2010, 76(4): 1298-1300 

 

     

申请专利

 

1、Tingyi Wen,Liu Shuwen, Liang Yong, Shang Xiuling, Liu Qian, Wen Jifu, Zhang Yun. E. coliengineering bacteria producing 1, 5-pentanediamine through whole cell catalysis and application thereof.Patent No. US15122340申请日:2016-08-29,授权日:2018-7-10      

2、Tingyi Wen,Liu Shuwen, Liang Yong, Shang Xiuling, Liu Qian, Wen Jifu, Zhang Yun. EngineeredEscherichia colifor producing 1,5-pentanediamine by whole-cell catalysis and application thereof. Patent No. EP15812527.申请日:2016-09-02,授权日:2019-07-31 

3、Tingyi Wen,Liu Shuwen, Liang Yong, Shang Xiuling, Liu Qian, Wen Jifu, Zhang Yun.全細胞触媒による1,5-ペンタンジアミン生産用の大腸菌工学菌およびその応用.专利授权号:JP2016551240.申请日:2015-02-04,授权日:2019-09-15 

4、温廷益,刘树文,梁勇,商秀玲,刘茜,温际富,张芸.全细胞催化生产1, 5-戊二胺的大肠杆菌工程菌及应用.专利授权号:CN201580005254.5.申请日:2015-06-25,授权日:2019-08-06. 

5、温廷益,刘树文,张芸,商秀玲;色氨酸衰减子突变体及其应用以及解除色氨酸衰减子反馈阻遏的方法;专利授权号: ZL20171038772.0,申请日:2017-05-27,授权日期: 2020-07-17 

6、温廷益,刘树文,商秀玲,张芸;组氨酸衰减子突变体和解决反馈阻遏的组氨酸操纵子以及它们的应用;专利授权号: ZL201710403398.7,申请日:2017-06-01,授权日期: 2020-05-08 

7、刘树文,温廷益,孙建建,肖海涵,张芸,商秀玲;苯丙氨酸衰减子突变体和解决反馈阻遏的苯丙氨酸操纵子以及它们的应用;专利授权号: ZL201710403515.X,申请日:2017-06-01,授权日期: 2020-05-08 

8、刘树文,温廷益,肖海涵,孙建建,张芸,商秀玲;ilv衰减子的突变体、相关工程菌及其在生产缬氨酸中的应用;专利授权号: ZL20171038774.X,申请日:2017-05-27,授权日期: 2020-04-09 

9、 刘树文,温廷益,商秀玲,张芸;苏氨酸衰减子的突变体及其应用以及解除苏氨酸操纵子反馈阻遏的方法;专利授权号: ZL201611035232.6,授权日期: 2019.12.20 

10、 温廷益,刘树文,肖海涵,孙建建,张芸,商秀玲;基于ilv衰减子的工程菌及其在生产异亮氨酸中的应用;专利授权号: ZL20171038810.2,申请日:2017-05-27,授权日期: 2019-10-25 

11、 温廷益;刘树文;梁勇,张芸,商秀玲。一种催化生产1, 5-戊二胺的工程菌及其应用。专利授权号:ZL201410302561.7申请日:2014-06-27,授权日:2018-12-12 

12、 刘树文,温廷益,商秀玲,张芸;一种5’-UTR元件及其在生产中的应用;专利授权号: ZL201610907080.3,申请日:2016-11-09,授权日:2018-11-22 

13、 温廷益,刘树文,梁勇,刘茜,温际富;一种动态调控苏氨酸外排转运蛋白基因表达生产L-苏氨酸的方法;专利授权号: ZL201410050917.2,申请日:2014-02-14,授权日:2018-11-13 

14、 温廷益,刘树文,梁勇,商秀玲,张芸。解除反馈抑制的thrA基因突变体及其应用。专利授权号:ZL201510796363.5.申请日:2015-11-18,授权日:2018-08-17 

15、 马吉银,温廷益,刘树文,梁勇,李戴欢,张芸,商秀玲,赵春光,郭小炜,孟刚。 包括二氧化碳脱除工艺的发酵生产戊二胺的方法。专利授权号:ZL201610322421.5.申请日:2016-05-06,授权日:2017-05-24