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本刊是国际菌物学界信赖的刊物之一，也是我国自然科学核心期刊。已被国际国内著名重要数据库和检索期刊收录，促进了国内外学术交流，主要包括Index Copernicus；CA (美国“化学文摘”)； Abstracts of Mycology (美国“菌物学文摘”)；Index of Fungi (英国“菌物索引”)；Review of Plant Pathology (英国“植物病理学文摘”)；Bibliography of Systematic Mycology (英国“系统菌物学文献目录”)；Bibliographie der Pflanzenschutz literature(德国“植物保护文献目录”)；中国科技信息研究所数据库（CJCR）；中科院文献情报中心《中国科学引文数据库》（CSCI）；《中国学术期刊文摘》；《中国农业文摘》；《中国生物学文摘》；北京大学图书馆《中文核心期刊要目总览》。
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