重要生物制剂的生物合成与代谢调控研究组

 
组长:温廷益 博士、研究员

 

  

 研究组研究方向

 

    以微生物和真核细胞为研究对象,设计构建基因组规模代谢网络模型,并在其指导下利用系统生物学和合成生物学的方法,研究氨基酸、核苷酸及其衍生物的生物合成和代谢调控机制,阐明氨基酸、核苷酸代谢与肿瘤发生及代谢性疾病的相关性。解析重要生命活动和代谢过程中关键酶的晶体结构,指导蛋白质定向进化,改造酶分子特性。开发高效基因组编辑、新型调控元件、生物传感器等合成生物学技术,应用于重要生物基产品(氨基酸、核苷酸、维生素及有机胺等)和生物制剂(疫苗、抗体及生物大分子等)细胞工厂的构建及产业化。

 

 

研究组研究内容及意义 

 

1、  基因组编辑和合成生物学工具的开发应用 

系统建立了微生物的高效基因组编辑新技术,创建微生物菌种改造与创新平台。首次提出了“DNA甲基化模式模拟MoDMP的科学概念,通过模拟顽固细菌DNA甲基化模式,穿越其限制修饰屏障,在多个难转化工业微生物菌种中实现了遗传操作。建立了限制性修饰系统介导、毒素-抗毒素反筛模块控制和CRISPR-Cas9系统介导的新基因组编辑技术和多元重组工程技术,提高了菌种遗传改造效率。建立大肠杆菌、芽胞杆菌、谷氨酸棒杆菌及酵母菌的高效基因组编辑方法,构建新型的合成生物学元件库,设计适用于工业生产的代谢调控开关,进行代谢网络的精细动态调控。 

2、 网络模型设计构建高效合成氨基酸和维生素的菌种 

采用元件筛选-途径设计组装-合成体系构建-效能提升的研究思路,研究遵循筛选-设计-组装-优化-提升的递进式模式,开发高效合成氨基酸及维生素的菌种。通过高通量测序技术分析基因组代谢网络,利用基因组规模代谢网络模型,整合各种组学数据,人工计算并设计目标产物的合成网络;建立高通量催化和调控元件库的构建技术,利用基因组编辑技术优化合成网络,结合代谢途径分析和代谢模块平衡,突破生物合成的瓶颈,构建具有自主专利保护的菌种;解析代谢动态调控机制,提升氨基酸及维生素的合成效能;建立与菌种适配的发酵生产工艺,提升组氨酸、脯氨酸、缬氨酸、维生素B5等的产酸量和糖酸转化率,实现工业化生产。 

3研发氨基酸衍生物产品的高纯度低成本的全套生产技术 

通过对氨基酸衍生产品合成模块的组装和代谢途径的优化,构建高催化性能的氨基酸衍生物戊二胺、5-氨基戊酸、白藜芦醇等菌种,实现戊二胺、5-氨基戊酸、白藜芦醇等高效生物合成;研发聚酰胺5X的聚合工艺并表征其性能,建立生物催化、分离提取和产品制备的具有自主专利保护的全套生产工艺,实现聚酰胺的绿色生物制造,引领中国氨基酸工业开拓新兴的产业领域。 

 

 

 研究队伍

 

研究组长

研究组长:温廷益

博士,中国科学院微生物研究所二级研究员,中国科学院特聘研究员,博士生导师

电子邮件:wenty#im.ac.cn(请将#替换成@)

电话:010-64806119

通讯地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号

邮编:100101

 

主要学习及工作经历

1982-1986年 南开大学,微生物学,学士 

1986-1989年 南开大学,微生物学,硕士 

1999-2002年 南开大学,微生物学,博士 

1989-2004年 天津中医药大学第一附属医院,国家中管局三级分子生物学实验室主任,研究员 

2004-2005年 国家科研中心(CNRS),UPR9073,博士后 

2005-至今 中国科学院微生物研究所,研究员,博士生导师 

2015-至今 中国科学院大学存济医学院,岗位教授 

 

获奖情况

1、“从玉米到服装”入选中科院建院70周年创新成果展(2019年) 

2、 第三届中国-阿拉伯国家技术转移与创新合作大会“十项主推重要技术成果”(2019年) 

3、 第九届中国技术市场“金桥奖”先进个人奖(2018年) 

4、 中国科学院 “朱李月华优秀教师奖”(2015年) 

5、 银川市产学研合作奖(2014-2015年度) 

6、 中国科学院科技促进发展奖科技贡献奖(2014年度) 

7、 中国科学院“优秀研究生指导教师奖”(2013年) 

8、政府特殊津贴(2007年) 

9、 中华中医药学会科学技术奖一等奖(2004年度) 

10、中华中医药学会科学技术奖二等奖(2003年度) 

11、天津市科技进步二等奖(2000年读) 

12、天津市科技进步二等奖(2002年度) 

13、天津市科技进步二等奖(1997年度)  

 

 

  团 队 

 

 

工作人员

      博士、副研究员 zhangyun@im.ac.cn 

      邓爱华 博士、副研究员 dengah@im.ac.cn 

     刘树文 博士、副研究员 liusw@im.ac.cn 

     刘述春 助理研究员     liusc@im.ac.cn

  

 在读研究生 

   李明杰 硕士生2021 - 

     硕士生2020- 

   王珺玥 硕士生2019 - 

     硕士生2018 - 

   王雪亮 硕博生2018 - 

   李忠财 博士生2018 - 

   师瑞琳 博士生2019 - 

     博士生2019 - 

     直博生2017 - 

   肖海涵 博士生2016 - 

  

 客座人员 

孙佳慧 硕士生(河北大学,2020 - 

  

 已毕业学生  

邓爱华博士2007-2011 

张国强博士2007-2012 

 博士2009-2012 

 博士2009-2014(中国科学技术大学联合培养) 

 博士2010-2013 

刘树文博士2010-2013 

 博士2012-2015 

孙召朋博士2011-2014 

 博士2013-2016 

 博士2014-2019 

王来友博士2015-2018 

Odesanmi Christianah Afolake硕士2017-2021 

王甜甜硕士2017-2020 

张芳芳硕士2017-2020(安徽大学联合培养) 

 硕士2016-2019 

 硕士2015-2019 

胡启跳硕士2015-2018 

孙建建硕士2015-2017(中国科学技术大学联合培养) 

邱起地硕士2014-2018 

温际富硕士2012-2015 

孙钦云硕士2012-2015 

石娜娜硕士2011-2016(中国科学技术大学联合培养) 

陶桐桐硕士2010-2012(中国科学技术大学联合培养) 

商秀玲硕士2010-2013 

 硕士2009-2011(中国科学技术大学联合培养) 

来书娟硕士2009-2012 

李昊剑硕士2008-2011(天津科技大学联合培养) 

 硕士2008-2011(天津科技大学联合培养) 

 硕士2007-2010(天津科技大学联合培养) 

闫继爱硕士2007-2010(天津科技大学联合培养) 

  

已离开工作人员 

孟宏宇 博士助理研究员 

  博士助理研究员 

商秀玲 硕士助理研究员 

  博士助理研究员 

张加利 硕士实习研究员 

  博士助理研究员 

 

 

  代表性论文(研究组部分第一作者或通讯作者论文)

 

1.  Aihua Deng, Zhaopeng Sun, Tiantian Wang, Di Cui, Lai Li, Shuwen Liu, Fei Huang andTingyi Wen*. Simultaneous Multiplex Genome Engineering via Accelerated Natural Transformation inBacillus subtilis.Frontiers in Microbiology.2021, 12: 714449. 

2.  Dalan Jing, Aihua Deng, Hongmei Wang, Yilin Chou, Xiaodan Jiang, Zhenxiang Chen, Xuemin Li, andTingyi Wen*.Comparative Evaluation of Bandage Contact Lenses and Eye Patching after Bilateral Cataract Surgery.Journal of Ophthalmology.2021,Article ID 2873543. 

3.  王雪亮,张芸*温廷益*,整合组学数据的代谢网络模型研究进展,《科学通报》2021192393-2404 

4.  Hua Bai#, Huibin Lv#, Aihua Deng, Xiaodan Jiang, Xuemin Li*,Tingyi Wen* Lysobacter oculi sp. nov., isolated from human Meibomian gland secretions.Antonie van Leeuwenhoek2020,113: 13-20. 

5.  Shuwen Liu#, Haihan Xiao#; Fangfang Zhang, Zheng Lu; Yun Zhang, Aihua Deng, Zhongcai Li, Cui Yang,Tingyi Wen*, A seamless and iterative DNA assembly method named PS-Brick and its assisted metabolic engineering for threonine and 1-propanol production.Biotechnology for Biofuels, 2019, 12: 180. 

6.  Di Cui, Aihua Deng, Hua Bai, Zhao Yang, Yong Liang, Zhe Liu, Qidi Qiu, Laiyou Wang, Shuwen Liu, Yun Zhang, Yi Shi, Jianxun Qi*,Tingyi Wen*, Molecular basis for feedback inhibition of tyrosine-regulated 3-deoxy-Darabino- 

heptulosonate-7-phosphate synthase fromEscherichia coli.Journal of Structural Biology.2019,206: 322-334.    

7.  Yu Zhang, Yun Zhang*, Xiuling Shang, Bo Wang, Qitiao Hu, Shuwen Liu,Tingyi Wen*.Reconstruction of TCA cycle inCorynebacterium glutamicumwith a genome‐scale metabolic network model for trans‐4‐hydroxyproline production.Biotechnology and Bioengineering.2019, 116(1): 99-109. 

8.  Laiyou Wang, Aihua Deng*, Yun Zhang, Shuwen Liu, Yong Liang, Hua Bai, Di Cui, Qidi Qiu1, Xiuling Shang, Zhao Yang, Xiuping He, andTingyi Wen*. Efficient CRISPR–Cas9 mediated multiplex genome editing in yeasts.Biotechnology for Biofuels.2018, 11: 277. 

9.  Wang Bo#, Hu Qitiao#, Zhang Yu, Shi Ruilin, Chai Xin, Liu Zhe, Shang Xiuling, Zhang Yun*,Wen Tingyi*. A RecET-assisted CRISPR-Cas9 genome editing inCorynebacterium glutamicumMicrobial cell factories. 2018, 17: 63. 

10. Xiaodan Jiang#, Aihua Deng#, Jiarui Yang#, Hua Bai, Zhao Yang, Jie Wu, Huibin Lv, Xuemin Li*,Tingyi Wen*. Pathogens in the meibomian gland and conjunctival sac: microbiome of normal subjects and patients with meibomian gland dysfunction.Infection and Drug Resistance. 2018, 11: 1729-1740. 

11. Jie Wu#, Aihua Deng#, Qinyun Sun, Hua Bai, Zhaopeng Sun, Xiuling Shang, Yun Zhang, Qian Liu, Yong Liang, Shuwen Liu, Yongsheng Che*,Tingyi Wen*. Bacterial genome editing via a designed Toxin-antitoxin cassette.ACS Synthetic Biology. 2018, 7(3): 822-823 (Cover Article). 

12.Yun Zhang, Xiuling Shang, Shujuan Lai, Yu Zhang, Qitiao Hu, Xin Chai, Bo Wang, Shuwen Liu,Tingyi Wen*. Reprogramming one-carbon metabolic pathways to decouple l-serine catabolism from cell growth inCorynebacterium glutamicum.ACS synthetic Biology. 2018, 7(2): 635-646. 

13. Hua Bai, Aihua Deng*, Shuwen Liu, Di Cui, Qidi Qiu, Laiyou Wang, Zhao Yang, Xiuling Shang, Yun Zhang,Tingyi Wen*. A novel tool for microbial genome editing using the restriction-modification system.ACS Synthetic Biology. 2018, 7(1): 98-106. 

14. Zhao Yang, Luyun He, Kaisu Lin, Yun Zhang, Aihua Deng, Yong Liang, Chong Li* &Tingyi Wen*. The KMT1A-GATA3-STAT3 circuit is a novel self-renewal signaling of human bladder cancer stem cells.Clinical Cancer Research. 2017, 23(21): 6673-6685. 

15. Yu Zhang, Jingyi Cai, Xiuling Shang, Bo Wang, Shuwen Liu, Xin Chai, Tianwei Tan, Yun Zhang* andTingyi Wen*. A new genome?scale metabolic model ofCorynebacterium glutamicumand its application.Biotechnology for Biofuels. 2017,10: 169. 

16. Xiuling Shang, Xin Chai, Xuemei Lu, Yuan Li, Yun Zhang, Guoqiang Wang, Chen Zhang, Shuwen Liu, Yu Zhang, Jiyin Ma,Tingyi Wen*. Native promoters ofCorynebacterium glutamicumand its application in L-lysine production.Biotechnology Letters.2017, 40(2): 383-391. 

17. Xin Chai, Xiuling Shang, Yu Zhang, Shuwen Liu, Yong Liang, Yun Zhang* andTingyi Wen*. A novel pyruvate kinase and its application in lactic acid production under oxygen deprivation inCorynebacterium glutamicum.BMC Biotechnology. 2016,16: 79. 

18.  Aihua Deng, Wei Lin, Nana Shi, Jie Wu, Zhaopeng Sun, Qinyun Sun, Hua Bai, Yongxin Pan,Tingyi Wen*. In vitro assembly of the bacterial actin protein MamK from ‘Candidatus Magnetobacterium casensis’ in the phylum Nitrospirae.Protein & Cell. 2016, 7(4): 267–280. 

19.  Qian Liu,Yong Liang, Yun Zhang,Xiuling Shang, Shuwen Liu, Jifu Wen,Tingyi Wen*.YjeH Is a Novel Exporter of L-Methionine and Branched-Chain Amino Acids inEscherichia coli.Applied and Environmental Microbiology. 2015, 81(22): 7753-7766. 

20. Zhaopeng Sun, Aihua Deng, Ting Hu, Jie Wu, Qinyun Sun, Hua Bai, Guoqiang Zhang,Tingyi Wen*. A high efficiency recombineering system with PCR-based ssDNA inBacillus subtilismediated by the native phage recombinase GP35.Applied Microbiology and Biotechnology. 2015; 99(12): 5151–5162. 

21. Aihua Deng, Guoqiang Zhang, Nana Shi, Jie Wu, Fuping Lu,Tingyi Wen*. Secretory expression, functional characterization and molecular genetic analysis of a novel halo-solvent-tolerant protease from Bacillus gibsonii.Journal of Microbiology and Biotechnology. 2014; 24(2): 197-208. 

22. Xiuling Shang#, Yun Zhang#, Guoqiang Zhang, Xin Chai, Aihua Deng, YongLiang,Tingyi Wen*.Characterization and Molecular Mechanism of AroP as an Aromatic Amino Acid and Histidine Transporter inCorynebacterium glutamicum.Journal of Bacteriology.2013, 195(23): 5334-5342. 

23. Jie Wu, Aihua Deng, Nana Shi, Shuwen Liu, Yong Liang,Tingyi Wen*.A salt, detergent, and solvent tolerant protease fromBacillussp. B001: low-cost, easy-purified, and enhanced production by raw material based culture strategy.Advances in Bioscience and Biotechnology.2013, 4(12): 1039-1048. 

24. Shuwen Liu, Yong Liang , Qian Liu, Tongtong Tao, Shujuan Lai, Ning Chen,Tingyi Wen*. Development of a two-stage feeding strategy based on the kind and level of feeding nutrients for improving fed-batch production of L-threonine byEscherichia coli.Applied Microbiology and Biotechnology. 2013, 97(2): 573–583. 

25. Guoqiang Zhang, Wenzhao Wang, Aihua Deng, Zhaopeng Sun, Yun Zhang1, Yong Liang, Yongsheng Che,Tingyi Wen*. A Mimicking-of-DNA-methylation-patterns Pipeline for Overcoming the Restriction Barrier of Bacteria.Plos Genetics .2012,8(9): e1002987. 

26.  Yun Zhang, Xiuling Shang, Shujuan Lai, Guoqiang Zhang, Yong Liang,Tingyi Wen*. Development and application of an arabinose-inducible expression system by facilitating inducer uptake inCorynebacterium glutamicum.Applied and Environmental Microbiology.2012,78(16): 5831-5838. 

27.  Aihua Deng, Zhaopeng. Sun, Guoqiang.Zhang, Jie Wu,Tingyi Wen*.Rapid discrimination of newly isolatedBacillaleswith industrial applications using Raman spectroscopy.Laser Physics Letters. 2012, 9(9): 636–642. 

28.  LAI ShuJuan, ZHANG Yun, LIU ShuWen, LIANG Yong, SHANG XiuLing, CHAI Xin,WEN TingYi*. Metabolic engineering and flux analysis ofCorynebacterium glutamicumfor l-serine production.SCIENCE CHINA Life Sciences. 2012, 55(4): 283–290 (Cover Article). 

29.  Yun Zhang, Xiuling Shang, Aihua Deng, Xin Chai, Shujuan Lai, Guoqiang Zhang,Tingyi Wen*. Genetic and biochemical characterization ofCorynebacterium glutamicumATP phosphoribosyltransferase and its three mutants resistant to feedback inhibition by histidine.Biochimie. 2012, 94(3): 829-838. 

30.  Guoqiang Zhang, Aihua Deng, Qingyang Xu, Yong Liang, Ning Chen*,Tingyi Wen*. Complete genome sequence ofBacillus amyloliquefaciensTA208, a strain for industrial production of guanosine and ribavirin,Journal of Bacteriology. 2011, 193(12): 3142-3143. 

31.  Haojian Li#, Guoqiang Zhang#, Aihua Deng, Ning Chen,Tingyi Wen*. De novo engineering and metabolic flux analysis ofBacillus subtilisfor inosine biosynthesis.Biotechnology letters. 2011, 33(8): 1575–1580. 

32.  Aihua Deng, Jie Wu, Guoqiang Zhang,Tingyi Wen* .Molecular and structural characterization of a surfactant-stable high-alkaline protease AprB with a novel structural feature unique to subtilisin family.Biochimie.2011, 93(4): 783-791. 

33. Guoqiang Zhang, Peng Bao, Yun Zhang, Aihua Deng, Ning Chen,Tingyi Wen*.Enhancing electro-transformation competency of recalcitrantBacillus amyloliquefaciensby combining cell-wall weakening and cell-membrane fluidity disturbing.Analytical Biochemistry.2011, 409(1): 130–137. 

34. Zhongyuan Liu , Qiangjun Zhou, Xinfang Mao , Xiangdong Zheng , Jiubiao Guo , Fuchun Zhang ,Tingyi Wen*and Hai Pang*. Crystallization and preliminary X-ray analysis of cecropin B fromBombyx mori.Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun.2010, 66: 851-853. 

35.  Aihua Deng, Jie Wu, Yun Zhang, Guoqiang Zhang,Tingyi Wen*. Purification and characterization of a surfactant-stable high-alkaline protease fromBacillussp. B001.Bioresource Technology.2010, 101(18): 7100-7106. 

36.  Ning Chen, Jin Huang, Zhibin Feng, Lei Yu, Qingyang Xu,Tingyi Wen*. Optimization of fermentation conditions for the biosynthesis of L-threonine byEscherichia coli.Applied Biochemistry and Biotechnology. 2009, 158(3): 595-604.  

 

 

 研究中代表性图片

 

 

 

 申请专利

 

已授权的PCT专利: 

 

1、 Tingyi Wen, Liu Shuwen, Liang Yong, Shang Xiuling, Liu Qian, Wen Jifu, Zhang Yun. E. coliengineering bacteria producing 1, 5-pentanediamine through whole cell catalysis and application thereof. Patent No. US15122340申请日:2016-08-29,授权日:2018-7-10 

2、 Tingyi Wen, Xiuling Shang, Yun Zhang, Shuwen Liu, Yong Liang, Yu Zhang. Recombinant strain producing L-amino acid, constructing method therefor and method for producing L-amino acid. Patent No. US14891622.申请日:2015-02-4,授权日:2017-10-24 

3、 温廷益,商秀玲,张芸,刘树文,梁勇,张宇。産L-アミノ酸の組換え菌およびその構築方法。专利授权号:JP2016515651.申请日:2015-02-4,授权日:2017-08-10    

4Tingyi Wen, Xiuling Shang, Yun Zhang, Shuwen Liu, Yong Liang, Yu Zhang. Recombinant strain producing L-amino acid, constructing method therefor and method for producing L-amino acid. Patent No. KR1020157032480.申请日:2015-02-4,授权日:2018-10-26 

5、 温廷益,张国强,邓爱华。標的細菌の制限修飾バリアを乗り越えて外来性DNAを導入する方法。专利授权号:JP6140804.申请日:2013-02-21,授权日:2017-05-12 

6、 Tingyi Wen, Guoqiang Zhang, Aihua Deng. Method for introducing an exogenous DNA by owercoming the restriction modification barrier of a target bacterium. Patent No. US14385940.申请日:2013-02-21,授权日:2017-03-28 

7、 马吉银,温廷益,陈金龙,梁勇,刘树文,魏爱英,杨立鹏,任瑞,孟刚赵春光,张芸,商秀玲,郭小炜。用改变乌头酸酶基因和/或其调控元件的细菌发酵生产L-赖氨酸的方法,专利授权号:ZL201480002118.6.申请日:2014-01-07,授权日:2015-11-25 

8、 Ma Jiyin,Wen Tingyi, Chen Jinlong, Liang Yong, Liu shuwen, Wei Aiying, Yang Lipeng, Ren Rui, Meng Gang, Zhao Chunguang, Zhang yun, Shang Xiuling, Guo xiaowei. L-lysine generation method by fermenting bacteria having modified aconitase gene and/or regulatory element. Patent No. EP14748825.申请日:2014-01-07,授权日:2015-01-14 

9、 Tingyi Wen, Liu Shuwen, Liang Yong, Shang Xiuling, Liu Qian, Wen Jifu, Zhang Yun. EngineeredEscherichia colifor producing 1,5-pentanediamine by whole-cell catalysis and application thereof. Patent No. EP15812527.申请日:2016-09-02,授权日:2019-07-31 

10、 Tingyi Wen, Xiuling Shang, Yun Zhang, Shuwen Liu, Yong Liang, Yu Zhang. Recombinant strain producing L-amino acid, constructing method therefor and method for producing L-amino acids. Patent No. EP2015748508.申请日:2015-02-04,授权日:2019-07-03 

11、 Ma JiyinWen TingyiChen JinlongLiang YongLiu shuwenWei AiyingYang LipengRen RuiMeng GangZhao ChunguangZhang yunShang XiulingGuo xiaowei. Method for producing L-lysine by modifying aconitase gene and/or regulatory elements thereof. Patent No. US14384370.申请日:2014-01-07,授权日:2015-01-14 

12、Tingyi Wen, Liu Shuwen, Liang Yong, Shang Xiuling, Liu Qian, Wen Jifu, Zhang Yun.全細胞触媒による1,5-ペンタンジアミン生産用の大腸菌工学菌およびその応用.专利授权号:JP2016551240.申请日:2015-02-04,授权日:2019-09-15 

13、马吉银,温廷益,陈金龙,梁勇,刘树文,魏爱英,杨立鹏,任瑞,孟刚赵春光,张芸,商秀玲,郭小炜. L-lysine generation method by fermenting bacteria having modified aconitase gene and/or regulatory element.专利授权号:KR1020157024148.申请日:2014-01-07,授权日:2020-06-22 

14温廷益,刘树文,梁勇,商秀玲,刘茜,温际富,张芸. Engineered Escherichia coli for producing 1, 5-pentanediamine by whole-cell catalysis and application thereof.专利授权号:KR1020167015924.申请日:2016-06-15,授权日:2020-05-15 

15、马吉银,温廷益,陈金龙,梁勇,刘树文,魏爱英,杨立鹏,任瑞,孟刚赵春光,张芸,商秀玲,郭小炜.アコニターゼ遺伝子および/またはその調節エレメントの改変により、L-リジンを生産する方法.专利授权号:JP6335196B2.申请日:2016-10-11,授权日:2018-05-11. 

16、 温廷益,商秀玲,张芸,刘树文,梁勇,张宇.一种产L-氨基酸的重组菌、其构建方法及L-氨基酸生产方法.专利授权号:ZL201580000936.7.申请日:2015-02-04,授权日:2019-08-20. 

17、 温廷益,刘树文,梁勇,商秀玲,刘茜,温际富,张芸.全细胞催化生产1, 5-戊二胺的大肠杆菌工程菌及应用.专利授权号:CN201580005254.5.申请日:2015-06-25,授权日:2019-08-06. 

  

已授权的国内发明专利: 

 

1、杨昭,温廷益,李翀,邓爱华,商秀玲,徐银燕,何璐云;一种膀胱癌干细胞鉴定的试剂盒及其应用;专利授权号:ZL201710585316.5,申请日:2017-07-18授权日期:2021-09-07 

2、温廷益,商秀玲,张芸,刘树文;生产L-组氨酸的重组菌、其构建方法以及L-组氨酸的生产方法;专利授权号:ZL201810118782.7,申请日:2018-02-06授权日期:2021-03-30 

3、温廷益,王来友,邓爱华,商秀玲;目的基因多拷贝整合的方法、重组菌、白藜芦醇以及重组人血清白蛋白的制备方法;专利授权号:ZL201810054262.4,申请日:2018-01-19授权日期:2020-09-08 

4、温廷益,刘树文,张芸,商秀玲;色氨酸衰减子突变体及其应用以及解除色氨酸衰减子反馈阻遏的方法;专利授权号:ZL20171038772.0,申请日:2017-05-27授权日期:2020-07-17 

5、温廷益,张宇,张芸,商秀玲,刘树文,王博;一种提高谷氨酸棒杆菌氨基酸产量的方法及其应用;专利授权号:ZL201610546762.0,申请日:2016-07-12授权日期:2020-06-17 

6、温廷益,刘树文,商秀玲,张芸;组氨酸衰减子突变体和解决反馈阻遏的组氨酸操纵子以及它们的应用;专利授权号:ZL201710403398.7,申请日:2017-06-01授权日期:2020-05-08 

7、刘树文,温廷益,孙建建,肖海涵,张芸,商秀玲;苯丙氨酸衰减子突变体和解决反馈阻遏的苯丙氨酸操纵子以及它们的应用;专利授权号:ZL201710403515.X,申请日:2017-06-01授权日期:2020-05-08 

8、刘树文,温廷益,肖海涵,孙建建,张芸,商秀玲;ilv衰减子的突变体、相关工程菌及其在生产缬氨酸中的应用;专利授权号:ZL20171038774.X,申请日:2017-05-27授权日期:2020-04-09 

9、刘树文,温廷益,商秀玲,张芸;苏氨酸衰减子的突变体及其应用以及解除苏氨酸操纵子反馈阻遏的方法;专利授权号:ZL201611035232.6,授权日期:2019.12.20 

10、温廷益,邓爱华,吴杰,商秀玲,白桦,张芸,梁勇;细菌无痕遗传操作载体及其构建方法与应用;专利授权号:ZL201510744940.6,申请日:2015-11-05授权日期:2019-11-12 

11、温廷益,孙钦云,邓爱华,梁勇,商秀玲,吴杰,白桦;产肌苷的重组菌及其制备方法与应用;专利授权号:ZL201510977763.6,授权日期:2019.10.25 

12、温廷益,刘树文,肖海涵,孙建建,张芸,商秀玲;基于ilv衰减子的工程菌及其在生产异亮氨酸中的应用;专利授权号:ZL20171038810.2申请日:2017-05-27授权日期:2019-10-25 

13、温廷益,温际富,梁勇,张芸,刘树文,商秀玲,邓爱华,刘茜;生产L-2-氨基丁酸的重组菌及其制备方法与应用;专利授权号:ZL201510208576.1,申请日:2015-04-28授权日期:2019-09-10 

14、  马吉银,温廷益,陈金龙,梁勇,刘树文等。用乌头酸酶表达弱化和或酶活性降低的细菌发酵生产L-赖氨酸的方法。专利授权号:ZL201410207848.1.申请日:2013-02-08,授权日:2019-03-19 

15、  马吉银,温廷益,陈金龙,梁勇,刘树文等。用改变乌头酸酶调控元件的细菌发酵生产L-赖氨酸的方法。专利授权号:ZL201410248982.6.申请日:2014-07-07,授权日:2019-03-15 

16、  温廷益;刘树文;梁勇,张芸,商秀玲。一种催化生产1, 5-戊二胺的工程菌及其应用。专利授权号:ZL201410302561.7申请日:2014-06-27,授权日:2018-12-12 

17、刘树文,温廷益,商秀玲,张芸;一种5’-UTR元件及其在生产中的应用;专利授权号:ZL201610907080.3申请日:2016-11-09,授权日:2018-11-22 

18、  温廷益,刘树文,梁勇,刘茜,温际富;一种动态调控苏氨酸外排转运蛋白基因表达生产L-苏氨酸的方法;专利授权号: ZL201410050917.2,申请日:2014-02-14,授权日:2018-11-13 

19、  温廷益,刘树文,梁勇,商秀玲,张芸。解除反馈抑制的thrA基因突变体及其应用。专利授权号:ZL201510796363.5.申请日:2015-11-18,授权日:2018-08-17 

20、  温廷益,商秀玲,张芸,刘树文,梁勇。生产L-组氨酸的方法及其专用重组菌。专利授权号:ZL201410050868.2.申请日:2014-02-14,授权日:2018-03-23 

21、  马吉银,温廷益,刘树文,梁勇,李戴欢,张芸,商秀玲,赵春光,郭小炜,孟刚。包括二氧化碳脱除工艺的发酵生产戊二胺的方法。专利授权号:ZL201610322421.5.申请日:2016-05-06,授权日:2017-05-24 

22、  马吉银,温廷益,陈金龙,梁勇,刘树文等。用乌头酸酶表达弱化和或酶活性降低的细菌发酵生产L-苏氨酸的方法。专利授权号:ZL201410248983.0.申请日:2013-04-07,授权日:2014-07-23 

23、  马吉银,温廷益,陈金龙,梁勇,刘树文等。用改变乌头酸酶调控元件的细菌发酵生产L-赖氨酸的方法。专利授权号:ZL201310050196.0.申请日:2013-02-08,授权日:2014-01-15 

24、  温廷益,张芸,商秀玲,来书娟。一种阿拉伯糖诱导的表达载体及其构建方法和应用。专利授权号:ZL201210139353.0.申请日:2012-05-24,授权日:2013-12-18 

25、  温廷益,张国强,邓爱华。一种克服靶细菌限制修饰障碍导入外源DNA的方法。专利授权号:ZL201210080124.6.申请日:2012-03-23,授权日:2013-09-04 

26、  温廷益,刘树文,陈宁,梁勇,刘茜,陶桐桐。一种生产L-苏氨酸的方法。专利授权号:ZL201110279419.1.申请日:2011-09-20,授权日:2013-09-04 

27、  温廷益,邓爱华,吴杰。一株芽胞杆菌及其在生产蛋白酶中的应用。专利授权号:ZL201110362012.5.申请日:2011-11-15,授权日:2013-06-12 

  

已受理的PCT专利: 

 

1、 Tingyi Wen, Shuwen Liu, Yun Zhang, Xiuling ShangHaihan Xiao. Method for modifying amino acid attenuator and use thereof in production. EP 3533872A1 (2019) 

2、 温廷益,张琛,商秀玲,柴欣,张芸,刘树文,王国强,李忠财。生产L-赖氨酸的重组菌、其构建方法以及L-赖氨酸的生产方法。PCT/CN2018/087894 

3、 温廷益,刘树文,张芸,商秀玲,肖海涵。氨基酸衰减子的改造方法及其在生产中的应用。PCT/CN2017/107453 

4、 马吉银,温廷益,刘树文,梁勇,李戴欢,张芸,商秀玲,赵春光,郭小炜,孟刚。包括二氧化碳脱除工艺的发酵生产戊二胺的方法。PCT/CN2017/084552 

5、 马吉银,温廷益,陈金龙,梁勇,刘树文等。用改变乌头酸酶基因和/或其调控元件的细菌发酵生产L-赖氨酸的方法。PCT/C:2014/070228 

  

已受理的国内发明专利: 

 

1、 邓爱华,温廷益,陈振翔,王珺玥,刘树文。发酵生产嘌呤核苷的重组菌及其构建方法与应用。202110841732.3 

2、 温廷益,王来友,邓爱华,商秀玲。目的基因多拷贝整合的方法、重组菌以及重组人血清白蛋白的制备方法。202010799482.7 

3、 温廷益,刘喆,张芸,邓爱华,刘树文。SHMT2抑制剂在制备抑制膀胱癌细胞生长和转移的药物的药物中的应用。201911058182.7 

4、 温廷益,米杰,张芸,刘树文。全细胞催化生产5-氨基戊酸的工程菌及5-氨基戊酸的制备方法。201910342666.8 

5、 刘树文,温廷益,张芸,邓爱华。一种DNA组装的方法及其应用。201811613376.4 

6、 温廷益,胡启跳,张芸,刘树文。生产L-亮氨酸的重组菌、其构建方法及L-亮氨酸的生产方法。201810367158.0 

7、 温廷益,张宇,张芸,商秀玲,刘树文。DNA分子、表达载体、重组菌及其构建方法,以及羟脯氨酸的制备方法。201711165839.0 

8、 张芸,温廷益,商秀玲,刘树文。生产L-丝氨酸的重组菌及其构建方法。201711146433.8 

9、 温廷益,张琛,商秀玲,柴欣,张芸,刘树文,王国强,李忠财。生产L-赖氨酸的重组菌、其构建方法及L-赖氨酸生产方法。201711058221.4 

10、  刘树文,温廷益,张芸,商秀玲。电渗析法分离提取全细胞催化液中的戊二胺的方法。201711022772.5 

11、  温廷益,刘树文,马吉银,李戴欢,梁勇,商秀玲,张芸,邓爱华,郭小炜,赵春光。利用副产物二氧化碳自控pH的全细胞催化生产戊二胺的方法。201610227775.1