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合成生物学新方法开发和应用研究组

  组长:娄春波 博士、研究员 

   

研究组研究方向:

  合成生物学;人工生命的工程化设计原理和应用。

 

研究组研究内容及意义:

  1)基因回路的定量设计及微生物发酵智能开关设计; 

  2)优质生物元件库的表征、改造和利用; 

  3)中心代谢网络的理性设计、优化与再造; 

  4)大尺寸(>50k bp)天然产物基因簇的激活和重新编辑; 

  5)亚基因组水平DNA组装和编辑新技术; 

  6)人工生命系统的安全性和可控性; 

研究队伍 

研究组长:娄春波 博士、研究员

电话:010-64806105

电子邮件:louchunbo@gmail.com

通讯地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号,中国科学院微生物研究所

邮政编码:100101

 

学习经历:

1999年9月-2003年7月, 武汉大学物理学院,物理学专业,本科。

2003年9月-2009年6月, 北京大学物理学院和理论生物中心,软凝聚态专业,博士。

 

工作经历:

2009年8月-2011年8月, 加州大学旧金山分校,博士后。

2011年9月-2013年1月,麻省理工学院,博士后。 

 

组内工作人员: 

赵学金 助理研究员

杜沛 助理研究员

赵会伟 研究实习员

在读学生:

季翔宇 直博生

魏伟佳 直博生

宗夜晴 硕士生

侯君然 硕士生

王瑞沙 硕士生

苗晨思 科大联合培养硕士生

郭銛 硕士生 

陈泽华 硕士生 

 

代表性论文(* 通讯作者):

  15, Paired design of dCas9 as a systematic platform for the detection of featured nucleic acid sequences in pathogenic strains (2016) Zhang Y., Qian L., Wei W., …, Ouyang Q. *, & Lou C*. ACS synthetic biology. 10.1021/acssynbio.6b00215 

  14, Li, T., Ye, J., Shen, R., Zong, Y., Zhao, X., Lou, C. *, & Chen, G. Q. * (2016). Semi-rational approach for ultra-high poly (3-hydroxybutyrate) accumulation in Escherichia coli by combining one-step library construction and high-throughput screening. ACS synthetic biology. 10.1021/acssynbio.6b00083 

  13, Fang, M., Wang, T., Zhang, C., Bai, J., Zheng, X., Zhao, X., Lou, C. & Xing, X. H. (2016). Intermediate-sensor assisted push–pull strategy and its application in heterologous deoxyviolacein production in Escherichia coli. Metabolic engineering, 33, 41-51. 

  12, Zhang, H. M., Chen, S., Shi, H., Ji, W., Zong, Y., Ouyang, Q. *, & Lou, C*. (2015). Measurements of Gene Expression at Steady State Improve the Predictability of Part Assembly. ACS synthetic biology, 5(3), 269-273. 

  11, Zhang S, Zhao X, Tao Y* and Lou C*. (2015).A novel approach for metabolic pathway optimization: oligo-liker mediated assembly (OLMA) method. Journal of Biological Engineering, 9(1):1-10 

  10, Pei Du, Chensi Miao, Qiuli Lou, Zefeng Wang*, and Chunbo Lou* (2015). Engineering translational activators with CRISPR-Cas system. ACS synthetic biology. DOI: 10.1021/acssynbio.5b00130 

  9, Chaoxian Bai#, Yang Zhang#, Xuejin Zhao#, Yiling Hu, Sihai Xiang, Jin Miao, Lixin Zhang* and Chunbo Lou* (2015)  Exploiting a precise design of universal synthetic modular regulatory elements to unlock the microbial natural products in Streptomyces. PNAS, 112(39): 12181-12186. 

  8, Wenjun Jiang, Xuejin Zhao, Tslil Gabrieli, Chunbo Lou*, Yuval Ebenstein*, and Ting Zhu *. (2015). Cas9-Assisted Targeting of CHromosome segments CATCH enables one-step targeted cloning of large gene clusters. Nature communs,6. 

  7, Tingting Li#, Teng Li#, Weiyue Ji, Qiuyue Wang, Haoqian Zhang, Guo-Qiang Chen, Chunbo Lou* and Qi Ouyang*. (2015) Engineering of core promoter regions enables the construction of constitutive and inducible promoters in Halomonas sp. Biotechnol. J.  DOI: 10.1002/biot.201400828 

  6, Lou CB, Stanton B, Chen YJ Munsky B, Voigt CA. 2012. Ribozyme-based “insulator parts” buffer synthetic circuits from genetic context. Nature Biotechnol. 30(11), 1137-1142. 

  5, Moon TS, Lou CB, Stanton B, Tamsir A, Voigt CA. 2012. Genetic programs constructed from layered logic gates in single cells. Nature. 491(7423), 249-253. 

  4, Lou CB, Liu XL, et al. 2010. Synthesizing a novel genetic sequential logic circuit. Mol. Syst. Biol. 6:350. 

  3, Lou CB, Li ZY and Ouyang Q. 2008. A molecular model for persister in E. coli. J. Theor. Biol. 255: 205-209. 

  2, Yang XJ, Liu XL, Lou CB, Chen JG and Ouyang Q. 2008. A case study of the dynamics of In vitro DNA evolution under constant selection pressure. J. Mol. Evol. 

  1, Lou CB, Yang XJ, Liu XL, He B and Ouyang Q. 2007. A quantitative study of lambda-phage Switch and its components. Biophys J. 92: 2685-2693. 

  发明专利: 

  Lou, Chunbo, et al. "Synthetic biology tools." U.S. Patent Application No. 13/489,205. 

 
 
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