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极端微生物与工业合成生物技术研究组

组长:于 波 博士、副研究员

 

主要研究领域

   针对生物基化学品开发相关合成生物技术体系,侧重于生物基材料与高值化学品的微生物法生产:

   - 乳酸等生物基化学品的微生物合成技术与产业化开发

   - 具有工业应用潜力的极端酶与菌株的筛选、改造与应用

   - 芳香杂环类化合物的微生物转化

 

研究队伍

   青年课题组长:于 波 博士、副研究员

   电话:010-62555203;010-64807618

   传真:010-62555203

   电子邮件:yub@im.ac.cn

   通讯地址:北京市海淀区中关村北二条8号,中国科学院微生物研究所(老所)507

   邮编:100190

学习经历

   1997-2001  山东大学,生物技术专业,学士

   2001-2006  山东大学,资源与环境微生物学专业,博士

 

工作经历

   2006-2008  中国科学院微生物研究所,助理研究员

   2008-2010  德国Helmholtz Centre for Infection Research  博士后

         德国Hamburg University of Technology 博士后

   2010-    中国科学院微生物研究所,青年研究组长

 

获奖情况

   2008年 德国洪堡学者(Alexander von Humboldt Fellowship)

   2008年 全国百篇优秀博士论文提名奖

   2007年 山东省优秀博士论文奖

   2007年 山东大学优秀博士论文奖

   2006年 山东省优秀毕业生

 

工作人员

   王丽敏 副研究员 wanglimin@im.ac.cn

 

在读研究生

   管祥辰  硕士生  xiangchenguan@gmail.com

   朱凌峰  硕士生  zlf541955821@126.com 

 

项目聘用人员

   梁 音 liangyin88@sina.com

 

客座学生

   李  媛 硕士生 hbhhliyuan@126.com

   薛张伟 硕士生 xuezhangwei1125@126.com

   王爱妍    782266199@qq.com

 

承担课题

   国家自然科学基金“专一性同时脱硫脱氮菌株的构建及其在原油生物处理中的应用”(2012-2015)

   国家自然科学基金青年基金“芽孢杆菌产高光学纯L-乳酸的关键酶基础研究”(2010-2013)

   973计划重大科学问题导向项目“人工合成细胞工厂”(2011-2015),子课题

   国家863计划重大课题“新一代聚乳酸的生物—化学组合合成技术” (2011-2015),子课题

   中国科学院知识创新工程重要方向项目“高浓度和高光学纯D-乳酸生物制造的核心技术研究” (2011-2013)

   中科院微生物研究所科技成果转化基金“高浓度、高光学纯D-乳酸生物制造的产业化开发” (2011-2012)

 

代表性论文

[1]

Yu B*, Su F, Wang LM, Xu K, Zhao B, and Xu P. Draft genome sequence of Sporolactobacillus inulinus strain CASD, an efficient D-lactic-acid-producing bacterium with high concentration lactate tolerance capability. J. Bacteriol. 2011, in press.

[2]

Yu B, Sun JB, Bommareddy RR, Song LF, Zeng AP. Novel (2R,3R)-2,3- butanediol dehydrogenase from potential industrial strain Paenibacillus polymyxa ATCC 12321. Appl. Environ. Microbiol. 2011, 77: 4230-4233.

[3]

Tao F, Liu YH, Luo Q, Su F, Xu YQ, Li FL, Yu B, Ma CQ, and Xu P. Novel organic solvent-responsive expression vectors for biocatalysis: application for development of an organic solvent-tolerant biodesulfurizing strain. Biores. Technol. 2011, 102: 9380-9387.

[4]

Su F, Yu B, Sun JB, Ou HY, Zhao B, Wang LM, Qin JY, Tang HZ, Tao F, Jarek M, Scharfe M, Ma CQ, Ma YH, and Xu P. Genome sequence of thermophilic strain Bacillus coagulans 2-6, an efficient producer of high optical purity L-lactic acid. J. Bacteriol. 2011, 193:4563-4564.

[5] Wang LM, Zhao B, Liu B, Yang CY, Yu B, Li QG, Ma CQ, Xu P, Ma YH. Efficient production of L-lactic acid from cassava powder by Lactobacillus rhamnosus. Biores. Technol. 2010, 101: 7895-7901.
[6]

Wang LM, Zhao B, Liu B, Yu B, Ma CQ, Su F, Hua DL, Li QG, Ma YH, Xu P. Efficient production of L-lactic acid from corncob molasses, a waste by-product in xylitol production, by a newly isolated xylose utilizing Bacillus sp. strain. Biores. Technol. 2010, 101: 7908-7915.

[7] Yu B, Zhang XL, Li Y, Ma YH. Cell factories for Biorefinery. China Basic Science, 2009, 5: 14-19 (in Chinese).
[8] Qin JY, Zhao B, Wang XW, Wang LM, Yu B, Ma YH, Ma CQ, Tang HZ, Sun JB, Xu P. Production of L-lactic acid by a newly isolated thermophilic strain Bacillus sp. 2-6. PLoS ONE 2009, 4(2): e4359
[9] Li JC, Feng JH, Li Q, Ma CQ, Yu B, Gao C, Xu P. Both FMNH2 and FADH2 can be utilized by the dibenzothiophene monooxygenase from a desulfurizing bacterium Mycobacterium goodii X7B. Biores. Technol. 2009, 100: 2594-2599.
[10] Xu P, Feng JH, Yu B, Li FL, Ma CQ. Recent developments of biodesulfurization of fossil fuels. Adv Biochem Engin/Biotechnol, 2009, 113: 255-274.
[11] Gai ZH#, Yu B#, Wang XY, Deng ZX, Xu P. Microbial transformation of benzothiophenes, with carbazole as the auxiliary substrate, by Sphingomonas sp. strain XLDN2-5. Microbiology-SGM, 2008, 154: 3804-3812 (#Equal contributors)
[12] Xu P, Gai ZH, Yu B, Ma CQ. Microbial degradation of carbazole and dibenzofuran by genus Sphingomonas: perspective and challenge. (2008) In Shuang-jiang Liu and Harold L. Drake eds. Microbes and the Environment: Perspectives and Challenges (Chapter 13): 89-96, Science Press, Beijing, China.
[13] Gai ZH#, Yu B#, Li L, Wang Y, Ma CQ, Feng JH, Deng ZX, Xu P. Cometabolic degradation of dibenzofuran and dibenzothiophene by a newly isolated carbazole-degrading Sphingomonas sp. strain. Appl. Environ. Microbiol. 2007, 73: 2832-2838 (#Equal contributors)
[14] Wang X, Gai ZH, Yu B, Feng JH, Xu CY, Yuan Y, Li ZX, Xu P. Degradation of carbazole by microbial cells immobilized in magnetic gellan gum gel beads. Appl. Environ. Microbiol. 2007, 73: 6421-6428.
[15]

Hua DL, Ma CQ, Lin S, Song LF, Deng ZX, Maomy Z, Zhang ZB, Yu B, Xu P. Biotransformation of isoeugenol to vanillin by a newly isolated Bacillus pumilus strain: identification of major metabolites. J. Biotechnol. 2007, 130: 463-470.

[16] Xu P, Yu B*, Li FL, Cai XF, Ma CQ. Microbial degradation of sulfur, nitrogen and oxygen heterocycles. Trends Microbiol. 2006, 14: 398-405.
[17]

Yu B, Xu P, Zhu SS, Cai XF, Wang Y, Li L, Li FL, Liu XY, Ma CQ. Selective biodegradation of S and N heterocycles by a recombinant Rhodococcus erythropolis strain containing carbazole dioxygenase. Appl. Environ. Microbiol. 2006, 72: 2235-2238.

[18] Yu B, Xu P, Shi Q, Ma CQ. Deep desulfurization of diesel oil and crude oils by a newly isolated Rhodococcus erythropolis strain. Appl. Environ. Microbiol. 2006, 72: 54-58.
[19] Yu B, Ma CQ, Zhou WJ, Zhu SS, Wang Y, Qu JY, Li FL, Xu P. Simultaneous biodetoxification of S, N and O pollutants by engineering a carbazole-degrading gene cassette in a recombinant biocatalyst. Appl. Environ. Microbiol. 2006, 72: 7373–7376.
[20]  Yu B, Ma CQ, Zhou WJ, Wang Y, Cai XF, Tao F, Zhang Q, Tong MY, Qu JY, Xu P. Microbial desulfurization of gasoline by free whole-cells of Rhodococcus erythropolis XP. FEMS Microbiol. Lett. 2006, 258: 284-289.
[21] Tao F#, Yu B#, Xu P, Ma CQ. Biodesulfurization in biphasic systems containing organic solvents. Appl. Environ. Microbiol. 2006, 72: 4604-4609. (#Equal contributors)
[22]  Feng JH, Zeng YY, Ma CQ, Cai XF, Zhang Q, Tong MY, Yu B, Xu P. Surfactant Tween 80 enhances biodesulfurization. Appl. Environ. Microbiol. 2006, 72: 7390-7393.
[23] Li L, Li QG, Li FL, Shi Q, Yu B, Liu FR, Xu P. Degradation of carbazole and its derivatives by a Pseudomonas sp. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2006, 73: 941-948.
[24] Yu B, Huang J, Cai XF, Liu XY, Ma CQ, Li FL, Xu P. A novel method for conversion of valuable BDS intermediates HPBS/Cx-HPBS from DBT/Cx-DBT. Chinese Chem. Lett. 2005, 16: 935-938.

 

 

授权专利

  1.一种生产D-乳酸的方法及其专用芽孢乳杆菌。授权专利号: 200710176056.2

  2.一种生产L-乳酸的方法及其专用凝结芽孢杆菌。授权专利号: 200710176060.9

  3.一株红平红球菌及其在原油脱硫中的应用。授权专利号:200510044599.X

  4.一株基因重组的红平红球菌及其在脱除原油有害物--硫和氮中的应用。授权专利号:200610042259.8

  5.一株可耐受有机溶剂的恶臭假单胞菌及其在双液相反应中的应用。授权专利号:200610044410.1

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