> 工业微生物分子生理学和系统生物技术研究组----中国科学院微生物研究所
 
网站地图 联系我们 English 中国科学院
首页 概况简介 机构设置 人才队伍 研究生/博士后 院地合作 国际交流 科研平台 学术出版物 党建 文化 科学传播 信息公开  
研究体系
微生物资源与大数据中心
微生物资源前期开发国家重点实验室
真菌学国家重点实验室
中国科学院微生物生理与代谢工程重点实验室
植物基因组学国家重点实验室
中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室
技术转移转化中心
学术团队
环境微生物与生物技术研究中心
分子病毒研究中心
分子免疫研究中心
结核药物研发中心
您现在的位置:首页 > 机构设置 > 研究体系 > 中国科学院微生物生理与代谢工程重点实验室
工业微生物分子生理学和系统生物技术研究组
组长:李 寅 博士、研究员

主要研究领域

研究方向为工业微生物分子生理学和系统生物技术,主要研究内容包括:
1、分子生理学和代谢工程。以乳酸菌及嗜酸、嗜碱、耐溶剂微生物为模型,利用基因组学和功能基因组学技术进行分子生理学研究,理解这些微生物过量合成大宗化学品的分子基础和调控机制,并在此基础上设计新的代谢工程策略,对微生物进行系统生物技术改造,实现大宗化学品的经济、绿色生产。
2、支撑系统生物技术的方法学。发展重要生物基化学品产生菌的高通量筛选方法,新型原核微生物遗传操作系统和基因组规模突变技术,不同水平(DNA、RNA、蛋白质、代谢物、代谢通量)组学数据的整合方法学,以及基因组规模代谢模型的构建及生物学功能预测方法。

研究队伍

课题组长:李 寅 博士、研究员
电话:010-64807485
传真:010-64807485
电子邮件:yli@im.ac.cn
通讯地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号,
中国科学院微生物研究所
邮编:100101

学习经历

1991-1995 无锡轻工大学,发酵工程专业,学士
1995-2000 无锡轻工大学,发酵工程专业,博士

工作经历

2000-2001   江南大学生物工程学院,讲师
2001-2002   荷兰Wageningen Centre for Food Sciences,NIZO Food Research,博士后
2003-2004   江南大学生物工程学院,副教授
2004-2006   爱尔兰University College Cork,Research Officer
2006-     中国科学院微生物研究所研究员、博士生导师
2007.6-2008.6 中国科学院微生物研究所,能源与工业生物技术中心主任

获奖情况

2006年国家科技进步二等奖
2004年教育部提名国家科技进步二等奖
2003年中国石油与化学工业技术发明一等奖
2003年江苏省科技进步二等奖
2000年无锡市十大杰出青年

学术兼职

《生物工程学报》,副主编(2007.9-)
中国科学院青岛生物能源与过程研究所(筹),学术委员会副主任(2007.9-)
中国科技大学,兼职博士生导师(2007.4-)
江南大学,兼职教授

工作人员

张延平 助理研究员 zhangyp@im.ac.cn
张艳禾 博 士 后 yhz7606@yahoo.com.cn

贾开志 博 士 后 jiakaizhi@yahoo.com.cn
朱泰承 博 士 后 zhutc@im.ac.cn

在读研究生
王少华 博士生 wangshaohua2003@126.com
毛绍名 博士生 msm526@163.com
朱 岩 博士生 riyeyan@163.com
董红军 博士生 redarmy305@gmail.com
解 鹃 硕士生 xiejuan6662008@yahoo.com.cn
王润江 硕士生 wangrunjiang@163.com
栾国栋 硕士生 gdluan@yahoo.cn
鲍冠辉 硕士生 guanhui323@hotmail.com
葛少林 硕士生 shaolinge222@sina.com
戴宗杰 硕士生 dzj2004@126.com

项目聘用人员
周 杰 jiezhouw@im.ac.cn
张天瑞 myparadise365@yahoo.com.cn
徐洪涛 xuhongtao800115@163.com
朱林江 zhulinjiang2008@126.com
张 博 zhangboonline@163.com
李 岩 liyan_213@163.com
赵秋伟 zhaoqiuwei@im.ac.cn
游丽金 ylj.0224130@yahoo.com.cn

已毕业客座研究生
王鑫昕 硕士生 xinxinwang779@yahoo.com.cn
郑学瑞 硕士生 roseyat@hotmail.com

 

承担课题

国家自然科学基金“谷胱甘肽合成能力在微生物适应非适宜生境中的生理作用”(2009-2011),负责人
中国科学院知识创新工程重大项目“纤维素乙醇的高温发酵和生物炼制”课题3“高温乙醇菌的系统生物技术改造”(2008-2012),负责人
863计划目标导向专题课题“丁醇生物制造的关键技术”(2006-2008),负责人
中国科学院知识创新工程重要方向项目“聚合级手性乳酸生物制造的关键技术” (2006-2009),负责人
973计划项目“生物炼制细胞工厂的科学基础”(2007-2012),子课题负责人
壳牌石油公司委托研究项目“新型生物燃料”(2008-2011),负责人
DSM公司委托研究项目“新型生物基化学品”(2008-2010),负责人
保罗生物园科技公司委托研究项目“益生菌产品开发”(2008-2010),负责人

已完成课题

国家外国专家局引智项目“纤维素乙醇的生物炼制”,(2007-2008)
国家自然科学基金“乳酸乳球菌中谷胱甘肽还原酶和谷胱甘肽过氧化物酶的生理功能”(2004-2006)
江苏省自然科学基金“多重维生素营养缺陷型球拟酵母中的能量代谢”(2002-2004)

主要论著
 Lactic Acid Bacteria: Genomics, genetics, physiology, and application

1

Zhu Y, Zhang Y, Li Y. Understanding the industrial application potential of lactic acid bacteria through genomics (mini-review). Appl. Microbiol. Biotechnol., 2009, 83(4): 597-610.

2

Zhang J, Du GC, Zhang Y, Liao XY, Wang M, Li Y, Chen J. Glutathione maintains the membrane integrity of Lactobacillus sanfranciscensis during cryodamage. Appl. Environ. Microbiol., 2009

3

Fang F, Flynn S, Li Y, Claesson MJ, van Pijkeren JP, Collins JK, van Sinderen D, O'Toole PW. Characterization of endogenous plasmids from Lactobacillus salivarius UCC118. Appl. Environ. Microbiol., 2008, 74(10): 3116-3128.

4

Ryan KA, Daly P, Li Y, Hooton C, O’Toole PW. Strain-specific inhibition of Helicobacter pylori by Lactobacillus salivarius and other lactobacilli. J. Antimicrobial. Chemotherapy, 2008, 61(4): 831-834.

5

Li Y, Canchaya C, Fang F, Raftis E, Ryan KA, van Pijkeren J-P, van Sinderen D, O’Toole PW. Distribution of megaplasmids in Lactobacillus salivarius and other lactobacilli. J. Bacteriol. 2007, 189(17): 6128-6139.

6

Zhang J, Fu R-Y, Hugenholtz J, Li Y* Chen J*. Glutathione protects Lactococcus lactis against acid stress. Appl. Environ. Microbiol., 2007, 73(16): 5268-5275.

7

Corr SC, Li Y, Riedel CU, O’Toole PW, Hill C, Gahan CGM. Bacteriocin production as a mechanism for the anti-infective activity of Lactobacillus salivarius UCC118. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2007, 104(18): 7617-7621. (cover article)
http://www.pnas.org/cgi/content/short/104/18/7617

8

Claesson MJ*, Li Y*, Leahy S, Canchaya C, van Pijkeren JP, Cerde?o-Tárragad AM, Parkhill J, Flynn S, Collins JK, Higgins D, Shanahan F, Fitzgerald GF, van Sinderen D, O'Toole PW. Multi-replicon genome architecture of Lactobacillus salivarius. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2006, 103(17): 6718-6723. (cover article) (*equally contributed to this work).
http://www.pnas.org/cgi/content/short/103/17/6718

9

Li Y, Raftis E, Canchaya C, Fitzgerald GF, van Sinderen D, O'Toole PW. Polyphasic analysis indicates that Lactobacillus salivarius subsp. salivarius and Lactobacillus salivarius subsp. salicinius do not merit separate subspecies status. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2006, 56(10): 2397-2403.

10

van Pijkeren JP, Canchaya C, Ryan KA, Li Y, Claesson MJ, Sheil B, Steidler L, O’Mahony L, Fitzgerald GF, van Sinderen D, O’Toole PW. Comparative and functional analysis of sortase-dependent proteins in the predicted secretome of Lactobacillus salivarius. Appl. Environ. Microbiol., 2006, 72(6): 4143-4153.

11

Ventura M, Canchaya C, Bernini V, Altermann E, Barrangou R, Mc Grath S, Claesson MJ, Li Y, Leahy S, Walker CD, Zink R, Neviani E, Steele J, Broadbent J, Klaenhammer TR, Fitzgerald GF, O’Toole PW, van Sinderen D. Comparative genomics and transcriptional analysis of prophages identified in the genomes of Lactobacillus gasseri, Lactobacillus salivarius and Lactobacillus casei. Appl. Environ. Microbiol., 2006, 72(5): 3130-3146.

12

Fu R-Y, Bongers BS, van Swam II, Chen J, Molenaar D, Kleerebezem M, Hugenholtz J, Li Y*. Introducing glutathione biosynthetic capability into Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 improves the oxidative-stress resistance of the host. Metab. Eng., 2006, 8(6): 662-671.

13

 Fu R-Y, Chen J, Li Y*. Heterologous production of transglutaminase in Lactococcus lactis significantly enhances the growth performance of the host. Appl. Environ. Microbiol., 2005, 71(12): 8911-8919.

14

 Li Y, Hugenholtz J, Sybesma W, Abee J, Molenaar D. Using Lactococcus lactis for glutathione overproduction. Appl. Microbiol. Biotechnol., 2005, 67(1): 83-90.

15

Li Y, Hugenholtz J, Abee J, Molenaar D. Glutathione protects Lactococcus lactis against oxidative stress. Appl. Environ. Microbiol., 2003, 69(10): 5739-5745.

专利

1

徐洪涛,张延平,李寅.一种筛选乳酸生产率高的菌株的方法.200810116218.8

2

徐洪涛,张延平,李寅.一种生产乳酸的方法及其专用植物乳杆菌.200810116194.6

3

张艳禾,张延平,李寅.一种培育抗盐胁迫乳酸乳球菌的方法及其专用培养基.200810116193.1
Industrial Biotechnology: efficient production of commodity and speciality chemicals

1

Zhang Y, Huang Z, Du C, Li Y, Cao Z. Introduction of an NADH regeneration system into Klebsiella oxytoca leads to an enhanced oxidative and reductive metabolism of glycerol. Metab. Eng., 2009, 11(2): 101-106

2

Du C, Zhang Y, Li Y, Cao Z. A novel redox-potential-based screening strategy for rapid isolation of Klebsiella pneumoniae mutants with enhanced 1,3-propanediol producing capability. Appl. Environ. Microbiol., 2007, 73(14): 4515-4521

3

Liu L-M, Li Y, Zhu Y, Du G, Chen J. Redistribution of carbon flux in Torulopsis glabrata by altering vitamin and calcium level. Metab. Eng., 2007, 9(1): 21-29.

4

Zhang Y, Li Y, Du C, Liu M, Cao Z. Inactivation of aldehyde dehydrogenase: a key factor for engineering 1,3-propanediol production by Klebsiella pneumoniae. Metab. Eng., 2006, 8(6): 578-586.

5

Liu L-M, Li Y, Chen J. Redirection of the NADH oxidation pathway in Torulopsis glabrata leads to an enhanced pyruvate production. Appl. Microbiol. Biotechnol., 2006, 72(2): 377-385.

6

Du C, Yan H, Zhang Y, Li Y, Cao Z. Use oxidoreduction potential as an indicator to regulate 1,3- propanediol fermentation by Klebsiella pneumoniae. Appl. Microbiol. Biotechnol., 2006, 69(5): 554-563.

7

Li Y, Wei G, Chen J. Glutathione: a review on biotechnological production. Appl. Microbiol. Biotechnol., 2004, 66(3): 233-242 (Mini-review)

8

Li Y, He N, Guan H, Du G, Chen J. A novel poly-galacturonic acid bioflocculant REA-11 produced by Corynebacterium glutamicum: A proposed biosynthetic pathway and experimental confirmation. Appl. Microbiol. Biotechnol., 2003, 63(2): 200-206.

9

Li Y, Hugenholtz J, Chen J, Lun S. Enhancement of pyruvate production by Torulopsis glabrata using a two-stage oxygen supply control strategy. Appl. Microbiol. Biotechnol., 2002, 60(1-2): 101-106.

10

Li Y, Chen J, Lun S, Rui X. Efficient production of pyruvic acid by Torulopsis glabrata: the key role of vitamins and its' optimization. Appl. Microbiol. Biotechnol., 2001, 55(6): 680-685.

11

Li Y, Chen J, Lun S. Biotechnological production of pyruvic acid. Appl. Microbiol. Biotechnol., 2001, 57(4): 471-479 (Invited mini-review)
专利

1

张天瑞,张延平,李寅.一种筛选解除葡萄糖代谢阻遏的丁醇产生菌突变株的方法.200810240858.x

2

张天瑞,张延平,李寅.高通量筛选溶剂产生菌溶剂产量.200810240859.4

3

王少华,张延平,董红军,李寅.重组梭菌及其构建方法与应用.200810239557.5

4

朱林江,张延平,李寅.合成谷胱甘肽的梭菌及其构建方法与应用.200810239559.4

5

董红军,张延平,李寅.重组丙酮丁醇梭菌及其构建方法与应用.200810239560.7

6

周杰,解鹃,高成华,张延平,李寅.一种重组蓝藻.200810239558.X

7

张延平,张天瑞,李寅.一种获得丁醇产生菌突变株的方法.200810239556.0

8

贾开志,李寅,张延平.一种生物传感器及其应用.200810239476.5

9

张延平,王鑫昕,李寅,王少华.一种生产丁醇的方法.200810239319.4

10

张延平,郑文超,王少华,李寅.一种发酵生产丁醇和丁二酸的方法.200810104083.3

11

王少华,张延平,李寅.一株丙酮丁醇梭菌及其应用.200810102673.2
著作

1

李寅,高海军,陈坚编著.高细胞密度发酵技术.北京:化学工业出版社,2006年10月

2

陈坚,李寅著.发酵过程优化原理与实践.北京:化学工业出版社,2002年4月

3

张艳禾,张延平,李寅.一种培育抗盐胁迫乳酸乳球菌的方法及其专用培养基.200810116193.1

 
1996-2014 中国科学院微生物研究所 版权所有   备案序号:京ICP备05064432号   文保网安备案号:110402500054
地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号  邮编:100101 电话:86-10-64807462 传真:86-10-64807468 Email:office@im.ac.cn