我所是国务院批准的首批具有博士、硕士授予权的科研单位，自1978年恢复研究生招生制度至今，共培养研究生近千名。最近几年来，硕士及博士招生中多项指标均名列全院前十名以内。逐步确立了从招生、培养、学位授予、就业等“全生命周期”管理的理念。研究生教育在研究所工作中的权重逐年增加，受到历任所领导的重视。目前我所设有微生物学、遗传学、生物化学与分子生物学三个二级学科，并设有博士后流动站；新增生物工程专业学位硕士培养点。
2020年5月14日下午，北京海外学人中心主持工作的虎翼熊副主任带队访问微生物所，调研外籍专家的签证、工作及生活等情况。微生物所副所长向华对海外学人中心领导和代表前来调研表示欢迎和感谢，他介绍了研究所的基本情况，以及微生物所在抗击“新冠病毒疫情”科研攻关工作。在国际合作方面，我所建有中日联合实验室，中科...
重点实验室研究方向分为三大方向：病原生物学与微生物组，免疫生物学与肿瘤免疫，以及药物、疫苗与细胞治疗。具体包括：1）流感病毒、冠状病毒、沙粒病毒和猪链球菌等动物源性病原分子进化及跨种传播机制，病原与宿主相互作用，结核分枝杆菌、乙肝病毒侵染机理、致病机制及治疗研究；2）T细胞/NK细胞识别分子机制，抗病毒免疫信号转导、病毒与癌基因诱发肿瘤发生机制和肿瘤免疫；3）微生物基因组、病原基因组及免疫基因组学，感染与免疫相关疫苗和药物的研发，微生物菌种改造的创新平台。
